(1) Αντιμικροβιακά πεπτίδια εντόμων: Τα έντομα αποτελούν τη μεγαλύτερη ομάδα οργανισμών και ο αριθμός των αντιμικροβιακών πεπτιδίων που παράγουν είναι τεράστιος. Μέχρι σήμερα, περισσότεροι από 200 τύποι αντιμικροβιακών πεπτιδίων εντόμων έχουν ταυτοποιηθεί σε οκτώ τάξεις, συμπεριλαμβανομένων των Λεπιδόπτερα, Διπτέρων, Κολεόπτερα και Οδονάτων. Συγκεκριμένα, 40 γονίδια αντιμικροβιακών πεπτιδίων έχουν απομονωθεί μόνο από τον μεταξοσκώληκα (*Bombyx mori*).
(2) Αντιμικροβιακά πεπτίδια θηλαστικών: Το αντιμικροβιακό πεπτίδιο θηλαστικών Cecropin P1 απομονώθηκε για πρώτη φορά από το λεπτό έντερο ενός χοίρου το 1989. Επί του παρόντος, τουλάχιστον 18 τύποι έχουν απομονωθεί από χοίρους, 30 από πρόβατα και 30 από βοοειδή.
(3) Αμφιβιακά αντιμικροβιακά πεπτίδια: Τα αμφίβια διαθέτουν γυμνό δέρμα που εκτελεί πολλαπλές λειτουργίες. Οι δερματικές τους εκκρίσεις περιέχουν μια τεράστια γκάμα βιοδραστικών πεπτιδίων με ποικίλες βιολογικές δραστηριότητες. Τα περισσότερα από αυτά παρουσιάζουν αντιμικροβιακές ιδιότητες. Αντιπροσωπεύοντας μια αρχαία και αποτελεσματική μορφή φυσικής άμυνας, ταξινομούνται γενικά ως αντιμικροβιακά πεπτίδια.
(4) Αντιμικροβιακά πεπτίδια από ψάρια, μαλάκια και μαλακόστρακα: Η παρδαξίνη, ένα υπολειμματικό πεπτίδιο 35-αμινο-αμινοξέος-που απομονώθηκε από τη σόλα του Μωυσή (*Pardachirus marmoratus*) το 1986, ήταν το πρώτο αντιμικροβιακό χαρακτηριστικό, αντιμικροβιακό σε πεπτιδικό ψάρι. -ελικοειδής δομή ικανή για διαπερατότητα μεμβράνης. Λειτουργεί ως ιοντική νευροτοξίνη και έχει αναπτυχθεί μια σειρά από παράγωγα πεπτίδια που παρουσιάζουν ισχυρότερη αντιμικροβιακή δράση-και χαμηλότερη αιμολυτική δραστηριότητα από τη μελιτίνη.
(5) Φυτικά αντιμικροβιακά πεπτίδια: Τα φυτά παράγουν επίσης αντιμικροβιακά πεπτίδια δομικά παρόμοια με τις αμυντικές ουσίες που βρίσκονται στα έντομα και τα θηλαστικά. Αυτά είναι γνωστά ως φυτικές άμυνες. Τα περισσότερα φυτικά αντιμικροβιακά πεπτίδια είναι ιδιαίτερα δραστικά έναντι φυτικών παθογόνων, αν και ορισμένα παρουσιάζουν επίσης τοξικότητα προς τα Gram-θετικά και τα Gram{3}}αρνητικά βακτήρια, τους μύκητες, τους ζυμομύκητες και τα κύτταρα θηλαστικών. Οι θειονίνες ήταν τα πρώτα αντιμικροβιακά πεπτίδια που απομονώθηκαν από φυτά.
(6) Βακτηριακά αντιμικροβιακά πεπτίδια: Γνωστά και ως βακτηριοσίνες, περιλαμβάνουν τόσο κατιονικά όσο και ουδέτερα πεπτίδια και εκκρίνονται τόσο από θετικά κατά Gram- και από αρνητικά κατά Gram-βακτήρια. Τέσσερις τύποι αντιμικροβιακών πεπτιδίων έχουν ταυτοποιηθεί στα βακτήρια: βακιτρακίνη, γραμμικιδίνη S, πολυμυξίνη Ε και νισίνη.
